深海中,褐藻和硅藻会合成一种名为 fucoidan 的复杂多糖,它构成藻体的保护层并能将碳长期储存在海底。fucoidan 的化学结构极其多样,包含数十种不同的键合方式和分支,使得单一微生物难以完全分解。长期以来,科学家只发现了能够分解 fucoidan 部分片段的细菌,却不清楚是否有微生物群落能够整体降解它。
最新的开放获取研究(发表于 Nature)由 Andreas Sichert(ETH Zurich)和 Otto X. Cordero(MIT)领衔。研究团队从沿海海水中富集出能够降解 fucoidan 的细菌群落,结果发现八株分离株共携带超过 453 种基因,每种基因编码一种针对 fucoidan 的酶。单独培养时,这些菌株都无法完整分解 fucoidan。
利用一种快速质谱技术,研究者追踪了细菌对单糖单元的消耗,发现两类功能角色主导降解过程:一类专门攻击 fucoidan 富含岩藻糖(fucose)的主链,另一类则分解侧链中的稀有糖(如木糖、半乳糖)。当两类菌株混合时,降解速率出现协同效应,远高于各自单独作用的简单相加。功能互补程度越高,协同效应越显著,部分混合群落甚至几乎完全降解了该多糖。
更令人惊讶的是,这种功能分工让系统的行为变得可预测。研究者构建了一个仅基于两类活性(岩藻糖 vs 侧链糖)的简化模型,用 1–3 株菌的实验数据进行训练后,能够准确预测包含至多 7 株菌的群落降解情况,并且同样适用于 9 种来自不同藻类的结构各异的 fucoidan。
该工作提出了 “多样性受限降解” 概念:缺少互补的细菌组合会导致 fucoidan 在海洋中停留更久,从而促进长期碳储存。对生物技术而言,与其打造单一的“超级菌”,不如组建功能互补的微生物团队,以高效处理褐藻生物质和其他复杂多糖。
更广阔的意义在于:即便面对数百种未鉴定酶的系统,只要找到合适的描述层级(如可测量的功能特征),就能用简洁模型预测微生物群落的功能。这为未来解析其他难以描述的生物聚合物提供了思路,也提示了生态系统中关键功能往往是由多种生物共同承担的。
点评:该研究展示了微生物协同作用的力量,提供了从基因复杂性到可操作模型的桥梁,为海洋碳循环和生物质利用打开了新视角。