自动化多智能体组织设计正从手工提示和工作流转向对智能体程序和交互结构的自动搜索。多智能体系统受到越来越多关注，但仍未解决的核心问题是：何时自动生成的多智能体结构能够形成有意义的职责划分。我们认为设计应超越寻找有效架构，转向识别哪些职责是功能上必需的、如何分配以及何时需要变更。为此提出 Automated Multi-Agent Organization Design (AMOD)，把组织本身视为首要设计对象，显式建模团队组成、功能职责、协同规则以及集体决策方式。AMOD 采用执行驱动的设计循环：对每个任务，自动设计器根据职责和协同规则实例化组织；执行后检查任务结果、产生的中间产物和交互轨迹，判断是否存在缺失、冗余或低效的职责，并据此修正组织。我们还提出通过在相同资源预算下删除职责、用通用角色替代或改变分配来检验发现的职责。该框架为基于证据的自适应多智能体组织设计提供了原则性基础。
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